Modèle d`évolution de population

Modélisation de la dynamique démographique des cellules cancéreuses. a) illustration schématique de la progression génétique des cellules initialement saines (cellules normales) à un cancer invasif en accumulant des mutations du conducteur. b) les courbes d`incidence de l`âge augmentent nettement au-dessus de l`âge de 50 et sont informatives sur la dynamique de la progression tumorale. La ligne droite montre un ajustement avec la puissance 4,8. La dépendance log-log-linéaire de l`incidence sur l`âge est utilisée dans la théorie à plusieurs stades pour estimer le nombre d`étapes limitant le taux de progression du cancer à partir des données d`incidence. c) les modèles de génétique de la population tels que le modèle Wright-Fisher peuvent être utilisés pour modéliser l`accumulation de mutations du conducteur par le biais de multiples expansions clonales et pour dériver les temps d`attente moyens τk pour un nombre donné de modifications k. d) dynamique d`une stratégie à trois jeu correspondant aux types de cellules A, B et C. Tandis que les modèles simples d`additif de conditionnement physique conduisent toujours à la survie du plus fort, la théorie de jeu évolutive compte des interactions cellulaires et permet des dynamiques plus complexes, telles que la coexistence stable des types de cellules. Indiqué ici est un équilibre stable avec la stratégie A et C, mais pas B, qui est atteint à partir des trois conditions de départ via les voies évolutives indiquées. Remarques: SNV, variante mono-nucléotide; ANC, l`aberration du numéro de copie; MCMC, Markov-chaîne Monte Carlo; EM, maximisation des attentes; HMM, modèle de Markov caché; L`évolution n`est pas seulement le développement de nouvelles espèces d`anciens, comme la plupart des gens supposent. C`est aussi les changements mineurs au sein d`une espèce de génération en génération sur de longues périodes de temps qui peuvent entraîner la transition progressive vers de nouvelles espèces. Le cancer est un processus évolutif somatique caractérisé par l`accumulation de mutations, qui contribuent à la croissance tumorale, la progression clinique, l`évasion immunitaire, et le développement de la résistance aux médicaments.

La théorie évolutive peut être employée pour analyser la dynamique des populations de cellules tumorales et pour faire l`inférence sur l`histoire évolutive d`une tumeur des données moléculaires. Nous examinons les approches récentes pour modéliser l`évolution du cancer, y compris les modèles de dynamique de population de l`initiation et de la progression des tumeurs, les méthodes phylogénétiques pour modéliser la relation évolutive entre les sous-clones tumoraux et les graphiques probabilistes modèles pour décrire les dépendances entre les mutations. La modélisation évolutive aide à comprendre comment les tumeurs se posent et jouera également un rôle pronostique de plus en plus important dans la prédiction de la progression de la maladie et le résultat des interventions médicales, telles que la thérapie ciblée. La sélection naturelle, qui comprend la sélection sexuelle, est le fait que certains traits rendent plus probable pour un organisme de survivre et de se reproduire. La génétique des populations décrit la sélection naturelle en définissant le conditionnement physique comme une propension ou une probabilité de survie et de reproduction dans un environnement particulier. La condition physique est normalement donnée par le symbole w = 1-s où s est le coefficient de sélection. La sélection naturelle agit sur les phénotypes, de sorte que les modèles génétiques de population supposent des relations relativement simples pour prédire le phénotype et donc la forme physique de l`allèle à un ou un petit nombre de loci. De cette façon, la sélection naturelle convertit les différences dans la condition physique des individus avec différents phénotypes en changements dans la fréquence des allèle dans une population au cours des générations successives.

Les modèles de génétique de population sont utilisés pour déduire quels gènes sont en cours de sélection. Une approche commune consiste à rechercher des régions de déséquilibre de liaison élevée et une faible variance génétique le long du chromosome, pour détecter les balayages sélectifs récents. Une dernière série de questions philosophiques entourant la génétique de la population concerne le lien de causalité. La biologie évolutive est considérée comme une science qui donne des explications causales: elle nous raconte les causes de phénomènes évolutifs particuliers (Okasha 2009).

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2019年2月13日 | カテゴリー : 未分類 | 投稿者 : 村人A